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Version française
Nous présentons ici les “pipelines” de pré-traitements communément utilisés lors de traitement de données acquises en Imagerie par Résonance Magnétique fonctionnelle (IRMf). Deux options sont proposées.
- La première option, sur environnement matlab, repose sur le logiciel “open-source” SPM12 (Statistical Parametric Mapping).
- La seconde utilise un “docker” (i.e. un environnement clé en main qui contient les librairies nécessaires au pré-traitement des données) connu sous le nom de fMRIPrep, développé par le laboratoire de Poldrack à Stanford.
Deux options de pré-traitement des données IRMf
1. SPM12
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English Version
In this page, we present pipelines for pre- and post-processing functional Magnetical Imaging Resonance (fMRI) data using the open-source package SPM12 (Statistical Parametric Mapping) within the Matlab environment. Two options are proposed.
- The first option, on matlab environment, is based on the “open-source” software SPM12 (Statistical Parametric Mapping).
- The second uses “docker” (i.e. a turnkey environment that contains the libraries necessary for pre-processing the data) known as fMRIPrep, déveloped by the Poldrack laboratory in Stanford.
Two options for pre-processing fMRI data
1. SPM12
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